জৈব ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ডেটা মাইনিং দিক
জৈব ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ডেটা মাইনিংর নিম্নলিখিত দিকগুলি রয়েছে:
বহুমূর্ত, বিতরণকৃত জিনোমিক ও প্রোটিওমিক ডেটাবেসের শব্দার্থক সংহতি
জিনোমিক ও প্রোটিওমিক ডেটা সেট একাধিক ল্যাব থেকে এবং বিভিন্ন পদ্ধতিতে তৈরি হয়। সেগুলো বিতরণকৃত, বহুমূর্ত, এবং ব্যাপক çeşitের। এসব ডেটার শব্দার্থক সংহতি জৈব রেকর্ডের ক্রস-সাইট বিশ্লেষণের জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।
আরো, গবেষণা সাহিত্য এবং তাদের সম্পর্কিত জৈব সত্তার মধ্যে সঠিক লিঙ্কেজ খুঁজে বের করা অপরিহার্য। এমন সংহতি ও লিঙ্কেজ বিশ্লেষণ জিনোম ও জৈব রেকর্ডের সুষম ও সমন্বিত বিশ্লেষণে সাহায্য করতে পারে। এই বিষয়টি জৈব ডেটা সংরক্ষণ ও পরিচালনার জন্য একীভূত ডেটা ওয়ারহাউস এবং বিতরণকৃত ফেডারেটেড ডেটাবেসের উন্নতিকে উদ্দীপিত করেছে।
ডেটা ক্লিনিং, ডেটা ইন্টিগ্রেশন, রেফারেন্স রিকন্সিলিয়েশন, শ্রেণিবিন্যাস, এবং ক্লাস্টারিং পদ্ধতি জৈব রেকর্ডের সংহতি এবং জৈব ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ডেটা ওয়ারহাউস উন্নতিতে সহায়তা করবে।
একাধিক নিউক্লিওটাইড/প্রোটিন ক্রমের অ্যালাইনমেন্ট, ইন্ডেক্সিং, সাদৃশ্য অনুসন্ধান, এবং তুলনামূলক বিশ্লেষণ
গত দুই দশকে 다양한 জৈব ক্রম অ্যালাইনমেন্ট পদ্ধতি উন্নত হয়েছে। BLAST এবং FASTA, বিশেষত, জিনোমিক ও প্রোটিওমিক ডেটার সুষম বিশ্লেষণের জন্য সরঞ্জাম। জৈব ক্রম বিশ্লেষণ পদ্ধতিগুলো ডেটা মাইনিং গবেষণায় প্রস্তাবিত বহু অনুক্রমিক প্যাটার্ন বিশ্লেষণ অ্যালগরিদম থেকে ভিন্ন।
এই পদ্ধতিগুলো একটি কোয়েরি ক্রম এবং অনুসন্ধান করা ক্রম ডেটার মধ্যে গ্যাপ ও মিসম্যাচ অনুমতি দিতে হবে ইনসারশন, ডিলিশন, এবং মিউটেশন মোকাবিলা করতে। আরো, প্রোটিন ক্রমের জন্য, দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডকে "ম্যাচ" হিসেবেও বিবেচনা করতে হবে যদি একটি অন্যটি থেকে প্রকৃতিতে সম্ভাব্য প্রতিস্থাপন দ্বারা পরিবর্তিত হতে পারে।
জিনেটিক নেটওয়ার্ক ও প্রোটিন পথের কাঠামোগত প্যাটার্ন আবিষ্কার ও বিশ্লেষণ
জৈব বিজ্ঞানে, প্রোটিন ক্রম তিন-মাত্রিক কাঠামোতে ফোল্ড হয়, এবং সে কাঠামোগুলো তাদের আপেক্ষিক অবস্থান এবং তাদের মধ্যে দূরত্বের ওপর ভিত্তি করে একে অপরের সাথে взаимодейন করে। এসব জটিল взаимодейন জটিল জিনেটিক নেটওয়ার্ক ও প্রোটিন পথের ভিত্তি গঠন করে।
এই বিশাল কিন্তু জটিল জৈব নেটওয়ার্কের মধ্যে কাঠামোগত প্যাটার্ন ও নিয়মিততা আবিষ্কার করা অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। এতদুই নিদর্শনের জন্য শক্তিশালী ও মাপনযোগ্য ডেটা মাইনিং পদ্ধতি উন্নত করা গুরুত্বপূর্ণ যাতে আনুমানিক ও ঘন কাঠামোগত প্যাটার্ন আবিষ্কার করা যায় এবং এই সংযুক্ত জৈব নেটওয়ার্কের মধ্যে নিয়মিততা ও অনিয়মিততা অধ্যয়ন করা যায়।
অ্যাসোসিয়েশন ও পথ বিশ্লেষণ
এটি সহ-ঘটনাশীল জিন ক্রম শনাক্ত করতে এবং জিনকে রোগ বিকাশের বিভিন্ন পর্যায়ের সাথে লিঙ্ক করতে পারে। অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ পদ্ধতি লক্ষ্য নমুনায় অনুসরণ করতে পারে এমন জিনের ধরন নির্ধারণ করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। এমন বিশ্লেষণ জিন দল আবিষ্কার এবং তাদের মধ্যে পারস্পরিকwirkung ও সম্পর্ক অধ্যয়ন করতে সাহায্য করবে।
